Eur J Endocrinol：石蜡标本转录组分析在肾上腺皮质癌诊断和预后中的重要性

背景：血清素胃癌(ACC)是一种鲜见的内分泌胃癌(每年每百万人里有1-2同上)，总基底高血压较差。病症对病征管理至关重要，但由于这种疾病的鲜见，病症很困难。事实上，在血清素(ACT)里，ACC是鲜见的，大多数是血清素腺瘤(ACA)。病理恶病态评分称为Weiss评分，最常用于病症。然而，具备里等评分和鲜见分组织学变异的不容易被分类学。特别是，已确定由大细胞核和驯酸病态颗粒分组成的驯酸病态变异基底的恶病态是具备挑战病态的。

ACC的5年总基底生存率一般低于40%，但异质病态。高血压分层对指导治疗决策很重要，特别是在专门设计治疗。临床上可用的主要高血压主因是有系统Ki-67游离比率。其他高血压主因通常有数皮质醇分泌和年龄。

以年前的原核生物学术研究表明，原核生物变解构分散在相同的分子亚改型。酪氨酸分组布谱是分子分类学的基石。酪氨酸分组布谱将血清素腺瘤与胃癌区外分泛化，并鉴定出新两分组与高血压密切相关的ACC：“C1a”亚分组，其游离突变过分表达出新来，高血压不良；“C1B”亚分组，具备免疫特征，高血压较好。从酪氨酸分组特征，已相符特定的mRNA上标，如BUB1BPINK1的歧异表征出新来。这些靶向上标物改善了ACC的病症和高血压评估。然而，到目年前为止，酪氨酸分组布谱及其靶向替代上标物值得注意高质量的RNA，须要高质量的融化分组织样品。在如前所述实践里，赚取这种类改型的塑料要求很高，而对于ACC病征来说，往往未能解决问题。

最近的3’RNA化学合成系统设计逃逸并化学合成了多腺苷解构RNA 3’端的短片段，这些片段不太容易被RNA降解。与表征出新来微阵列或规格的全长RNA化学合成相同，这种系统设计只须要少量和意味著的RNA，与福尔马林比较简单石蜡包埋(FFPE)样品适配器。

借此：主要借此是利用新的3’端RNA化学合成系统设计，已确定福尔马林比较简单石蜡包埋(FFPE)样品的酪氨酸分组布谱。第二个借此是通过重点学术研究鲜见的驯酸细胞核ACT变基底，展览品这种系统设计冒险大改型FFPE档案的控制能力。

新方法：我们纳入131同上ACT：来自科钦所医院的受训描述符和来自维尔茨堡所医院的单独验证描述符。用QuantSeq(Lexogen)和NextSeq500(Illumina)从FFPE样品里诱发3’酪氨酸分组。

结果：在受训描述符里，无监督聚类标识出新3分组：“C1A”改型首当其冲病态胃癌(N=28，29%)、“C1B”改型胃癌(N=28，29%)和“C2”改型腺瘤(N=39，41%)。FFPE酪氨酸分组的高血压效益在验证描述符里得到证实(5年OS：C1a分组为26%(N=26)，C1B分组为100%(N=10)，p=0.003)。在有数有系统和Ki-67的多变量模改型里，FFPE酪氨酸分组是一个单独的高血压主因(OS-HR 7.5，p=0.01)。驯酸病态上皮细胞核ACT(N=19)未形成任何特异簇。驯酸细胞核胃癌(N=6)和恶病态潜能未明的驯酸病态细胞核胃癌(N=4)之外为“C1B”。

布1.受训描述符里ACT的FFPE酪氨酸分组分类学A.基于2000个最易变的突变对ACT的非监督分类学已确定了三个主要分组，对应于“C1A”首当其冲病态胃癌、“C1B”惰病态胃癌和“C2”腺瘤。B.用于转换成非监督分类学的3个非负矩阵分解(NMF)等级的热布。荷尔蒙(人体内分解构)、游离和免疫征象在每种ACT里的表达出新来。D.三分组酪氨酸分组里歧异最显著的年前50个突变的表达出新来谱。即通过子程序聚类演算法对此样品之间的相似度的一致病态矩阵。行和列是病征样品。共识矩阵值的适用范围从0(从不聚在一起)到1(仍然聚在一起)。

布2.相同区外域的FFPE酪氨酸分组分类学。对受训描述符里5名病征的两个相同区外域进行苏木精/伊红/赛会弗兰染色(反转40倍)，其里一个为首当其冲病态(-a)区外，一个为非首当其冲病态(-b)区外。黑条代表50微米。黑色圆点对此生物合成。白色圆点对此不典改型的生物合成。B.描述为5名病征采样的两个相同的区外域，其里一个是首当其冲病态(-a)，另一个是首当其冲病态(-b)。不适用：Fuhrman核级不适用于驯酸病态细胞核。C.基于PCA的两个主成份(Dim1、Dim2)的样品投影基于受训描述符的95个独有病征里的2000个最可变突变。来自受训描述符的样品显示为酪氨酸分组班级着色的引人注意圆心。来自两个相同区外域的8名病征的样品按病征的颜色显示为全五边形。

布3.ACC验证描述符里的FFPE酪氨酸分组分类学和高血压A.样品投影基于PCA的两个主成份(Dim1，Dim2)，基于受训描述符里95个独有病征里最可变的2000个突变。来自受训描述符的样品显示为酪氨酸分组班级着色的引人注意圆心。来自验证描述符的样品以酪氨酸分组类别着色的基本五边形对此。B.根据验证描述符里I-III期ACC病征的预测酪氨酸分组类改型进行无病生存。根据验证描述符的I-IV期ACC病征的预测酪氨酸分组分类学，总的存活率。

得出结论：3’RNA化学合成法是从FFPE样品里已确定ACT分子类改型的一种简易新方法。这项系统设计应该有助于如前所述可用和大改型谈到学术研究。

原文出新处：Jouinot A, Lippert J, Sibony M,et al.Transcriptome in paraffin samples for the diagnosis and prognosis of adrenocortical carcinoma.Eur J Endocrinol 2022 Mar 01